Seis meses depois de o Sr. Hopp ter tirado tudo da pequena Ruby durante os eventos de A Casa de Brinquedo do Sr. Hopp, ele voltou para buscar mais.

Após um encontro próximo, Ruby acaba presa no Submundo, um reino onde almas perdidas vagam eternamente pela escuridão. Ela encontra outra garota humana chamada Esther e, juntas, elas precisam resolver quebra-cabeças, evitar armadilhas e superar inimigos infernais para encontrar os Seis Medalhões e pôr fim ao reinado da Entidade de uma vez por todas.

Corra e se esconda dos brinquedos que viraram monstros: Sr. Hopp, a lebre arrepiante, Sr. Listras, o tigre assustador, e Srta. Bo, a panda que causa pânico. Lute contra chefes gigantes que se erguem sobre você, ajude Ruby a encontrar seus pais perdidos e desvende o passado conturbado de Esther.

Mr. Hopp's Playhouse 3 é um jogo de aventura com elementos leves de combate e uma variedade de quebra-cabeças para resolver e progredir, apresentando um estilo gráfico inspirado nos primeiros jogos 3D do PS1 e N64.